Evaluation de la performance du test BD Phoenix NMIC 505 pour la détection et la classification des carbapénèmases

Abstract

Les entérobactéries productrices de carbapénèmases (EPC) constituent une menace pour la santé publique. Leur détection rapide et

fiable est devenue un défi majeur en microbiologie. Certains systèmes automatisés proposent ainsi la détection et la classification des carbapénèmases

chez ces EPC.

C’est dans ce cadre qu’on avait étudier la performance duBDPhoenix Emerge NMIC-505 panel dans la détection et la classification des carbapénèmases

chez les entérobactéries en comparaison avec la méthode moléculaire par PCR mutiplex.

Il s’agit d’une étude prospective menée sur une période de quatre mois (septembre- décembre 2022) incluant toutes les entérobactéries de

sensibilité diminuée aux carbapénèmes isolées chez les brûlés. Nous avons procédé pour chaque souche à une étude moléculaire pour la détection

des principaux gènes codant pour les carbapénèmases (blaKPC, blaNDM, blaVIM, blaIMP et blaOXA-48) par PCR multiplex en temps réel (type

CepheidGeneXpertCarba-R) parallèlement à une étude de la performance de BDPhoenix Emerge NMIC-505 panel pour la détection et la classification

de ces carbapénèmases.

Nous avons inclus 41 entérobactéries de sensibilité diminuée aux carbapénèmes. Selon l’étude moléculaire, 40 souches étaient productrices de

carbapénèmases dont 31 souches NDM, trois OXA-48, six souches productrices à la fois de deux types de carbapénèmases : cinq NDM+OXA-48 et une

NDM+VIM. Une seule souche avait une PCR négative.

Le BDPhoenix Emerge panel a montré une excellente performance pour la détection des carbapénèmases ; Nos 40 EPC ont été toutes catégorisées

productrices de carbapénèmase par cet automate. La souche ayant une PCR négative a été détectée comme productrice de carbapénèmase de classe

B par cette méthode.

La détermination de la classe des carbapénèmases par ce panel était concordante au génotype dans 65% des cas (26/40). Toutes les souches OXA-48

ont été correctement catégorisées (classeD) par le panel (3/3). Pour les souches NDM, 23/31 étaient correctement catégorisées (classe B), 7 étaient

non classées (classe indéterminée) et une souche était faussement classée (classe D). Les 5 souches NDM+ OXA48 étaient classées appartenant à

la classe D (4/5) ou à la classe B (1/5). En aucun cas, le panel BD Phoenix Emerge n’a spécifié les deux classes de carbapénèmases produites par la

même souche. Au total, le panel avait une sensibilité de 100% et une spécificité de 86.8% pour classer les carbapénèmases de type OXA-48 comme

appartenant à la classe D tandis qu’elles étaient de 66,6% et 77,7% respectivement pour catégoriser les carbapénèmases de type NDM comme

appartenant à la classe B.

Notre étude a montré une bonne performance du BDPhoenix Emerge NMIC-505 panel pour la détection des carbapénèmases chez les entérobactéries.

La classification des carbapénèmases était concordante au génotype pour les sérines-carbapénèmases (OXA-48), moins performante pour les métallob-lactamases (NDM) et pour les associations de deux types de carbapénèmases.